安装本地的blast+的教程，实测可以
安装本地版的 BLAST+ (Basic Local Alignment Search Tool Plus) 需要几个简单的步骤。下面是一个基本的安装教程，适用于 Windows、Mac 和 Linux 操作系统：
1. 下载 BLAST+ 软件
首先，你需要从 NCBI (美国国家生物技术信息中心) 的网站下载 BLAST+ 软件包：
- 访问 NCBI BLAST 下载页面：NCBI BLAST Download
- 根据你的操作系统选择合适的版本（例如 Windows 64位、Mac OS X 或 Linux）。
2. 安装 BLAST+
安装步骤根据你的操作系统略有不同：
对于 Windows：
- 解压下载的 ZIP 文件到你选择的目录。
- 可以将 BLAST+ 程序的目录添加到系统的 PATH 环境变量中，这样可以在任何命令行窗口中运行 BLAST+ 命令。
对于 Mac 和 Linux：
- 解压下载的压缩文件。
- 打开终端，切换到解压后的目录中。
- 可以使用如下命令将 BLAST+ 的 bin 目录添加到你的 PATH 环境变量中：把
1
export PATH=$PATH:/path/to/ncbi-blast-2.x.x+/bin
/path/to/ncbi-blast-2.x.x+/bin替换成实际的路径。
3. 测试安装
在命令行中输入以下命令来检查 BLAST+ 是否正确安装：
1 | blastn -version |
如果系统返回了 BLAST+ 的版本信息，说明你已经成功安装。
4. 使用 BLAST+
安装完成后，你可以开始使用 BLAST+ 来进行本地的序列比对。例如，使用 blastn 命令比对核酸序列：
1 | blastn -query my_query.fasta -db my_database -out results.txt |
这里，my_query.fasta 是你的查询序列文件，my_database 是你已经建立的数据库，results.txt 是输出结果文件。
5. 建立 BLAST 数据库
如果你需要对自己的序列数据进行比对，可能还需要建立一个 BLAST 数据库：
1 | makeblastdb -in my_data.fasta -dbtype nucl -out my_database |
这里，my_data.fasta 是你的序列文件，nucl 表示建立的是核酸数据库（对于蛋白质使用 prot），my_database 是数据库的名称。
以上就是 BLAST+ 的基本安装和使用教程。如果你在安装或使用过程中遇到问题，可以查看 NCBI 的官方文档或寻求社区的帮助。
windows配置系统变量，实测可以
在 Windows 系统中将 BLAST+ 程序的目录添加到 PATH 环境变量中，使得你可以在任何命令提示符窗口中运行 BLAST+，可以按照以下步骤操作：
Windows 10 和 Windows 11 操作步骤：
打开系统属性:
- 右键点击“此电脑”或“计算机”，选择“属性”。
- 在弹出的窗口中，点击左侧的“高级系统设置”。
环境变量:
- 在“系统属性”窗口中，找到“高级”标签页，并点击“环境变量”。
修改 PATH 环境变量:
- 在“环境变量”窗口中，找到“系统变量”区域下的“Path”变量，选择它，然后点击“编辑”。
- 在“编辑环境变量”窗口中，点击“新建”。
- 输入或粘贴你的 BLAST+ bin 目录的完整路径（例如：
D:\blast\ncbi-blast-2.15.0+-x64-win64 (1)\ncbi-blast-2.15.0+\bin）。 - 确认无误后，点击“确定”。
保存并退出:
- 依次点击所有打开的设置窗口的“确定”按钮以保存更改并关闭窗口。
验证 PATH 设置:
- 打开一个新的命令提示符窗口（重要：必须是更改环境变量之后打开的新窗口）。
- 输入
blastn -version并按回车，如果系统返回了 BLAST+ 的版本信息，说明 PATH 设置成功，你已经可以在任何地方通过命令行运行 BLAST+ 命令了。
通过这些步骤，你就可以在任何命令提示符窗口中运行 BLAST+ 命令了，无需每次都导航到 BLAST+ 的安装目录。这样会更加方便进行日常的生物信息分析工作。
