ID转换

NM_001017412.2批量转换

NM_001017412.2
NM_001024582.2
XM_040648734.2
XM_040648735.2
XM_040648731.2
XM_040648733.2
XM_046901532.1
我想批量搜这些，得到他们的基因名称，和长度，要怎么搜？

要在NCBI批量搜索并获取特定信息如基因名称和长度，你可以使用NCBI的批量搜索工具或者通过NCBI的API来实现。对于普通用户，一个简单有效的方法是使用NCBI的 Batch Entrez 工具来执行此操作。以下是具体步骤：

步骤 1: 准备你的查询列表

• 首先，准备一个包含你要查询的RefSeq访问号的列表，例如你提供的那些NM_和XM_编号。

步骤 2: 访问 NCBI Batch Entrez

• 打开 NCBI Batch Entrez 页面。Batch Entrez 允许你对NCBI的多个数据库进行批量查询。

步骤 3: 选择数据库并上传列表

1. 在 Batch Entrez 页面，选择“Nucleotide”作为目标数据库，因为你的列表是核苷酸序列的访问号。
2. 将你的访问号列表粘贴到提供的文本框中，或者通过“Choose File”上传包含这些访问号的文本文件。

步骤 4: 提交查询并查看结果

• 点击“Retrieve”按钮以提交你的查询。系统将处理你的请求并显示所有匹配的序列记录。

步骤 5: 导出数据

1. 一旦查询结果出现，你可以浏览每个序列的详细页面，查找基因名称和序列的长度等信息。
2. 要导出这些信息，你可以使用页面顶部的“Send to”选项：
   • 选择“File”作为目标。
   • 选择“Summary (text)”或其他适合的格式，这将提供一个包含基本信息的文本文件。
   • 点击“Create File”以生成并下载文件。

步骤 6: 查看和处理导出的数据

• 打开下载的文件，检查每个序列的相关信息。你可能需要手动查找或使用文本处理工具来提取特定的信息，如基因名称和序列长度。

这种方法可以有效地帮助你批量查询并导出多个序列的基本信息，适用于需要处理大量数据时的场景。如果你需要更详细或特定格式的数据，可以考虑使用更高级的脚本或编程方法，例如使用NCBI的E-utilities API进行自动化查询。

转换成功

1. Gallus gallus protein C receptor (PROCR), mRNA
   1,046 bp linear mRNA
   NM_001034820.1 GI:77736626

2. Gallus gallus major histocompatibility complex Y, class II beta BLB1 (BLB1), mRNA
   1,130 bp linear mRNA
   NM_001044679.2 GI:562815395

3. PREDICTED: Gallus gallus major histocompatibility complex Y, class I heavy chain 15 (MHCY15), transcript variant X3, mRNA
   2,603 bp linear mRNA
   XM_040648581.1 GI:2024360115

4. PREDICTED: Gallus gallus major histocompatibility complex Y, class I heavy chain 10 (MHCY10), transcript variant X2, mRNA
   1,932 bp linear mRNA
   XM_040648593.1 GI:2024360155

NCBI 别的ID应该可以

在NCBI使用高级搜索工具的步骤相对直接，可以让你更精确地搜索所需要的信息。下面是使用NCBI高级搜索工具的基本步骤：

步骤 1: 访问NCBI高级搜索界面

1. 首先，访问NCBI主页：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. 选择你想搜索的数据库，例如“Gene”。
3. 在搜索框旁边点击“Advanced”链接，这将带你进入高级搜索界面。

步骤 2: 构建搜索查询

1. 在高级搜索页面，你会看到一个“Builder”区域，其中列出了可以用于搜索的字段和索引。
2. 选择一个或多个特定字段，如“Gene Name”, “Organism”等，然后在旁边的输入框中填入相应的搜索词或表达式。
3. 可以通过点击“Add to History”来逐步构建复杂的查询条件，每次添加后都会保存在“History and Search Details”区域中。

步骤 3: 组合查询

1. 如果需要，你可以组合之前保存的多个搜索结果。选择“History and Search Details”，使用布尔运算符（AND, OR, NOT）来组合不同的搜索结果。
2. 每次操作后，系统会生成一个新的搜索结果编号，你可以继续使用这些编号进行更复杂的查询组合。

步骤 4: 执行搜索

1. 一旦构建好搜索条件，点击“Search”按钮来执行搜索。
2. 搜索结果将会展示在一个新的页面上，你可以浏览和查看详细信息。

步骤 5: 导出结果

1. 如果需要将结果导出，可以点击结果页面右上角的“Send to”按钮。
2. 选择“File”选项，并选择希望的文件格式，如CSV、Text等。
3. 点击“Create File”生成文件并下载。

提示：

• 使用高级搜索时，确保使用正确的字段名称和格式，这样可以确保搜索结果的精确性。
• 利用“History and Search Details”功能可以保存和重新使用旧的搜索查询，非常适合需要多步骤过滤数据的情况。

高级搜索是一个非常强大的工具，特别是当你需要处理复杂的查询或者大量的数据时。花时间熟悉不同的搜索字段和选项可以显著提高你的搜索效率。